Ecoinformática-AEET
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Seminarios


  • Seminario 1: Búsqueda, descarga y limpieza de datos de biodiversidad desde GBIF. Una odisea ecoinformática

    • Impartido por: Carlos Lara Romero, Universidad Rey Juan Carlos, Madrid

    • Resumen: La misión cardinal de GBIF es dar acceso, de manera libre y gratuita, a datos de biodiversidad para apoyar la investigación científica y fomentar la conservación biológica. La información disponible en GBIF se encuentra estructurada en diversos tipos de datos y metadatos. Esta estructura es uno de los mayores potenciales de GBIF, pero también dificulta el proceso de descarga de la información. El objetivo del seminario es dotar a los asistentes de la información y herramientas para desarrollar con éxito el proceso de búsqueda, descarga y limpieza de datos desde GBIF a través de su interfaz web y del paquete de R “rgbif”. Pero, sobre todo, con el seminario pretendo mostrar mi proceso de aprendizaje del lenguaje de programación R. Una odisea llena de frustración y fallo. De debilidad. Pero también de éxitos, satisfacción y crecimiento personal y profesional.

    • Fecha: 31 Enero 2022

  • Seminario 2: Estadística bayesiana: principios, teorema de bayes y su aplicación

    • Impartido por: Paloma Ruiz-Benito e Ignacio Morales-Castilla, Universidad de Alcalá (UAH), Madrid - grupo de EcoBayesUAH

    • Resumen: Repaso de los beneficios en el uso de una aproximación de la estadística bayesiana, explicación general del teorema de Bayes, y uso de ejemplos conceptuales y prácticos.

    • Fecha: 28 Febrero 2022

  • Seminario 3: Análisis de la ciencia ciudadana mediante modelos de ocupación

    • Impartido por: Guillermo Fandos Guzmán, Universidad Complutense de Madrid

    • Resumen: Durante este seminario vamos a ver los pasos iniciales básicos para aplicar los modelos de ocupación a los datos de ciencia ciudadana. Los modelos de ocupación nos permiten modelar conjuntamente el proceso ecológico de aparición de especies y el proceso de observación de la detección de especies, pero a su vez nos permite sacar estimas como procesos separados. Este marco analítico nos permite tener en cuenta la variación de la probabilidad de detección al estimar la presencia de las especies.

    • Link a datos y PDF: https://drive.google.com/drive/folders/1BX1js28MS-RSMFvTHoKJJ6iDY9wGNoAw

    • Fecha: 30 Marzo 2022

  • Seminario 4: Generación de visores de datos espaciales con R

    • Impartido por: Antonio J. Pérez-Luque, Estación Experimental del Zaidín CSIC, Granada

    • Resumen: ¿Necesitas mostrar información espacial sobre alguna de tus investigaciones? ¿Quieres compartir con tus colaboradores las zonas de tu muestreo de una forma sencilla? En este seminario introduciremos algunas herramientas para la creación de visores espaciales sencillos y prácticos que permitan mostrar tu información espacial combinándola con otras capas de información. Para ello, utilizaremos diferentes paquetes de R, y combinándolos con leaflet (una librería JavaScript), GitHub y servicios WMS, generaremos visores espaciales de una forma sencilla.

    • Link a presentación: https://ajpelu.github.io/visores_geograficos_r/slides.html

    • Link a repo de GitHub: https://github.com/ajpelu/visores_geograficos_r

    • Mapa de ejemplo: https://ajpelu.github.io/visores_geograficos_r_ejemplo/

    • Fecha: 5 Mayo 2022

  • Seminario 5: Análisis de dinámicas poblacionales en R

    • Impartido por: David García-Callejas, Landcare Research New Zealand, University of Canterbury

    • Resumen: Las poblaciones de diferentes especies varían en respuesta a toda una serie de factores, y la ecología matemática ha ido desarrollando, desde hace más de un siglo, las herramientas para analizar estas dinámicas. En este seminario haremos un repaso de los fundamentos ecológicos de algunas de estas herramientas, desde modelos de crecimiento exponencial a dinámicas Lotka-Volterra, y veremos cómo implementarlas en R. Hablaremos de dinámicas de especies individuales y de especies con diferentes tipos de interacciones, repasando funciones para evaluar su estabilidad o para representarlas gráficamente.

    • Link a repo de GitHub: https://github.com/garciacallejas/LV_dynamics

    • Fecha: 6 Junio 2022

  • Seminario 6: Introducción al análisis de datos con Python

    • Impartido por: Virginia Domínguez-García, Estación Biológica de Doñana - CSIC, Sevilla

    • Resumen: La programación se está volviendo más y más importante para el análisis de datos en todas las disciplinas. Aunque en ecología el lenguaje de programación más utilizado es R, en ocasiones conocer otros lenguajes puede facilitarte la vida pues diferentes librerías están más desarrolladas en uno u otro lenguaje (por ejemplo el machine learning en Python). Este taller es una introducción al uso de Python para el análisis de datos, en el que se cubrirán: la lectura (y escritura) de datos desde ficheros, la limpieza y re-estructuración de dichos datos, su análisis usando estadísticas simples, y finalmente la representación de los resultados. Para poder ir realizando los ejercicios propuestos se recomienda tener instalado Python (preferiblemente con Anaconda https://www.anaconda.com/products/distribution) antes de iniciar el taller, pero si las personas asistentes encuentran problemas con la instalación cubriremos esto al inicio del taller también.

    • Link a repo de GitHub: https://github.com/domgarvir/taller_python_data

    • Fecha: 5 Julio 2022